Το Αρχαιολoγικό Μουσείο της Αίγινας περιέχει αρχαία κατάλοιπα και κειμήλια. Υδρύθηκε το 1828 από τον Ιωάννη Καποδίστρια. Στο Μουσείο υπάρχουν διάφορα αγγεία, πήλινα, κεραμικά, αλάβαστρα, λύχνοι, αγαλματίδια, επιγραφές, νομίσματα, όπλα και χάλκινα σκεύη. Στον προθάλαμο του Μουσείου υπάρχει αναπαράσταση πρωτοελλαδικής κατοικίας, το λεγόμενο "λευκό σπίτι" με 1ο, 2ο όροφο και χυτήριο από χαλκό και στο αίθριο επιτύμβια ανάγλυφα από το νεκροταφείο της Ρήνειας. Το Μουσείο αποτελείται από 3 αίθουσες, μέσα στις οποίες υπάρχουν ταξινομημένα όλα τα εκθέματα.

Το Ιστορικό Μουσείο της Αίγινας βρίσκεται στην Οδό Σπύρου Ρόδη. Στο ισόγειο υπάρχει εκθεσιακός χώρος και παράλληλα χρησιμοποιείται σαν Πνευματικό Κέντρο. Στον πρώτο όροφο υπάρχουν πολλά ιστορικά και λαογραφικά εκθέματα. Στον κήπο του Μουσείου παρουσιάζονται συχνά διάφορες θεατρικές παραστάσεις.

Στην Αίγινα, εκτός από το Ιστορικό Μουσείο, υπάρχει στην βορειοδυτική πλευρά του νησιού, σε απόσταση 3 χλμ. περίπου από την πόλη, το Μουσείο του Χρήστου Καπράλου. Στο Μουσείο εκθέτονται έργα, πίνακες ζωγραφικής, γλυπτά, κεραμεικά και έργα από σφυρήλατο μολύβι και χαλκό.